Открытие реки Амазонки произошло в 1500 году. Это сделала испанская экспедиция, которая исследовала просторы Южной Америка и наткнулась на великую южноамериканскую реку. Экспедицией руководил Висенте Пинсона. Он и дал первое название открытой реке – река Святой Марии. Во время путешествия экспедиция поднялась по устью на восемьдесят километров. Стоит отметить, что устье и исток реки были открыты с большим разрывом во времени.

В 1539 году испанский завоеватель Перу решил исследовать леса на востоке от своих владений и поручил эту задачу губернатору Кито. Для этого была набрана экспедиция, которая состояла из трех сотен испанцев и нескольких тысяч индейцев-жителей Анд, последние служили носильщиками и слугами. Индейцы, всю жизнь прожившие в горах, погибали в страшном для них влажном и тропическом климате джунглей. В такой обстановке можно было легко подцепить множество неизвестных тогдашней науке болезней.

После этого испанцы решили построить корабль и перевозить на нем больных людей и снаряжение обратно в горы. Однако для этого пришлось бы плыть против течения, а тяжелое судно не было на это способно. Поэтому было принято решение послать небольшую экспедицию по реке, чтобы разведать местность и найти легендарную страну Маноа. В ней, согласно слухам, было много золота. Данную экспедицию возглавил офицер Франсиско де Орельяна, при этом экспедицию испанцы под руководством губернатора не дождались и отправились обратно. В итоге до Кито дошли всего девять человек. А вот Орельяна к тому времени дошел до устья Напо и вышел на великую реку Амазонку.

Первое путешествие по этой могучей реке предпринял французский ученый Кондамин, который отправился в экспедицию в 1743-1744 годах. В процессе своего путешествия он составил карту реки, исследовал флору и стал первооткрывателем каучукового дерева, добывая из него каучук и проводя различные эксперименты.

Уже в середине XIX века Амазонку исследовал английский ученый Генри Бейтс, обнаружив в джунглях около восьми тысяч неизвестных науке видов насекомых.

А в 1999 году было проведено спутниковое наблюдение за районом Амазонки в целях уточнения карты. Были официально признаны устье реки и исток.